Los entrenadores podrán compartir su Base Secreta con otros jugadores mediante la función StreetPass de las consolas o creando un QR Code único, de forma que amigos o jugadores puedan visitarla con facilidad. Al visitar las Bases de otros entrenadores, podremos invitar a otros jugadores, o al propio dueño de la Base como ‘Amigo Secreto’, lo que permitirá nuevas formas de interactuar, ya que además de librar combates, conocen técnicas especiales que serán de gran utilidad en la aventura, como la ayuda en la eclosión de Huevos, nuevos objetos decorativos, o incluso hacer que un Pokémon suba un nivel. Por otro lado, al visitar las Bases de otros jugadores, podremos reunir banderas que se encontrarán junto a los PC Secretos que hay en las bases. Las banderas permitirán el aumento de rango, así como ciertas recompensas, como que los ‘Amigos Secretos’ puedan aprender nuevas técnicas especiales.