Con el instigador del proyecto fuera Capcom, todo parecía indicar que Mega Man Legends 3, la última apuesta de Keiji Inafune dentro de la jerarquía de la compañía japonesa, tenia los días contados, y así a sido finalmente. En un comunicado remitido por la compañía japonesa, esta informa de la cancelación del desarrollo en los siguientes términos, y apuntando que el proyecto nunca recibió atención continúa. “Desafortunadamente sentimos que el proyecto Mega Man Legends 3 no cubría los criterios requeridos, y gran pena que debemos anunciar que Mega Man Legends 3 Proyect ha sido cancelado”.