La historia comienza cuando el Káiser Oblivion abduce a Agnès Oblige, la heroína de la entrega, y su guardaespaldas, Yew Geneolgia, jura rescatarla del Paraíso del káiser, una fortaleza que flota sobre Eternia. Por el camino, Yew tendrá que formar equipo con Magnolia Arch y otros personajes nuevos, así como con héroes de la anterior entrega como Edea Lee y Tiz Arrior, para superar mazmorras y derrotar a temibles enemigos.

Como en la primera entrega, los jugadores deben sopesar el riesgo y la recompensa en combates por turnos: los personajes pueden hacer múltiples movimientos en un mismo turno, pero esto les lleva a no poder moverse en los turnos subsiguientes. Una nueva función permitirá a los jugadores poner a prueba sus habilidades: tras ganar un combate en un solo turno, los guerreros pueden empezar uno nuevo inmediatamente, que será más difícil de superar para tratar de aumentar las recompensas. Para la ocasión, la entrega contará con 30 clases de personajes, conocidas como “trabajos”, para dotar a los protagonistas de las habilidades necesarias para sobrevivir. A medida que los personajes adquieran experiencia en su trabajo en los combates, aprenderán nuevos talentos y habilidades, lo que dará posibilidades tácticas completamente nuevas.

En su lanzamiento, el juego estará disponible en una Edición Coleccionista Deluxe que incluye un CD de la banda sonora original, una figura de Agnès y un libro de ilustraciones con alrededor de 250 páginas. También estará disponible en versión solus y en formato digital, que podrá ser descargada desde Nintendo eShop.

Por último, se ha confirmado que el próximo 11 de febrero estará disponible una demo prelanzamiento a través de Nintendo eShop centrada en los tres paladines del juego -Yew Geneolgia, Janne Angard y Nikolai Nikolanikov–, que servirá de preludio de la aventura y permitirá desbloquear recompensas en la versión completa del juego, dependiendo de cuánto hayan avanzado antes en la demo.