El juego está ambientado en un futuro lejano, en el que el Universo está sumido en una caótica Guerra. El mundo se halla dividido por las luchas, mechas gigantes, llamados Mobile Suits, se encaminan a la Guerra tanto por tierra como por el espacio. Incluye las características y los mechas extraídos de la serie de manga y anime Gundam, que debutara en televisión hace más de 30 años. El juego situará a los jugadores en una lucha galáctica con más de 50 personajes y más de 70 Mobile Suits manejables y actualizables, todos ellos extraídos del universo Gundam. Incluye nuevos Mobile Suit incorporados de las últimas entregas de la serie de anime, Mobile Suit Gundam 00, Mobile Suit Gundam UC, etc.
Dynasty Warriors: Gundam 3 cuenta también con un gran número de novedades incorporadas a su estilo de juego, tales como la inclusión de 3 nuevos sistemas, a saber, el Partner Strike, el Emergency Dash y Recovery Gauge, que mejoran el nivel táctico de la franquicia. El sistema Partner Strike permitirá al jugador solicitar la presencia de personajes amigos en el campo de batalla para que le ayuden en momentos cruciales, afectando al nivel de compromiso con la pelea de los personajes o, posiblemente, las condiciones globales de tu ejército en el campo de batalla. El Sistema Emergency Dash permitirá a los jugadores ejecutar movimientos de evasión y eliminación para anular los ataques enemigos. Este sistema ofrecerá un Nuevo nivel al estilo de juego ya que permitirá parar más fácilmente los poderosos combos. El Sistema de Recuperación (Recovery Gauge) permitirá a los jugadores recobrar la salud durante la batalla.