Capcom pretende ofrecer con este recopilatorio tanto el estilo de juego uno contra uno de Marvel Super Heroes con su sistema de Gemas Infinitas, y las peleas dos contra dos del original Marvel vs. Capcom: Clash of Super Heroes, con su mecánica de intercambios (tag system), las ayudas y el Ataque en Dúos por Equipos. El juego incluye un elenco de características que añadirá el sistema de juego online ampliado GGPO para hasta 8 jugadores y el modo espectador, actualizaciones gráficas en Alta Resolución, desafíos dinámicos y repeticiones salvadas. Con motivo de la confirmación de la fecha de lanzamiento se han distribuido nuevas pantallas ilustrativas del juego.