Pero vamos por partes, las alarmas han saltado en el nuevo organigrama empresarial de Konami, donde hasta la fecha, Kojima desempeñaba las funciones de director ejecutivo y vicepresidente junto a Shinji Enomoto, productor ejecutivo de la saga 'Pro Evolution Soccer', que también ocupaba la misma posición en el organigrama empresarial. Según se desprende del informe, tanto Kojima como Enomoto no formarían parte del personal.

Por otro lado la reestructuración también ha afectado a la cuenta oficial de Twitter de 'Metal Gear Solid', anteriormente conocida como '@Kojima_Pro_Live' en referencia al estudio Kojima Productions, que a partir de ahora dirige a los seguidores hacia '@metalgear_en'; del mismo modo que la web y el estudio de Kojima Productions se han convertido en el portal 'Metal Gear' de Konami, así como Konami Los Angeles Studio. Finalmente, la frase "A Hideo Kojima game" que acompañaba los títulos, parece ser que también ha sido eliminada de los productos de Konami. Ante tanto alboroto la editora se ha visto en la necesidad de dar explicaciones, confirmado que "Konami Digital Entertainment, y el señor Kojima, continuarán desarrollando y apoyando los productos Metal Gear. Por favor, estad atentos a futuros anuncios", reza el último comunicado.